Conférence, colloques

29 septembre – 4 octobre 2024 : Munschy C., Aminot Y., Caurant F., Méndez-Fernandez P., Mille T., Pollono C., Spitz J., Chouvelon T. (2024). Organohalogen contaminants of emerging concern in common dolphins from the Bay of Biscay (NE Atlantic) over the last two decades. Dioxin (International Symposium on Halogenated Persistent Organic Pollutants (POPs) 2024 (Singapour, Malaisie).

15-19 juillet 2024 : Ballutaud M., Doray M., Olmos M., Authier M. (2024). Challenging the predator-prey overlap metrics in spatial dentisity: a simulation approachInternational Statistical Ecology Conference 2024 (Swansea, Angleterre).

5-7 juin 2024 : Laran S., Authier M., Blanchard A., Doremus G., Genu M., Sanchez T. Van Canneyt O., Spitz J. (2024). Winter variations in the presence of surfacing marine megafauna on the shelf of the Bay of Biscay. Colloque ISOBAY (La Rochelle).

5-7 juin 2024 : Mille T., Caurant F., Méndez-Fernandez P., Pillet M., Spitz J., Viricel A., Alves F., Ferreira R., Covelo P., Pin X., López A., Torres-Pereira A., Eira C., Gaudino M., McHugh B., Murphy S., Chouvelon T. (2024). Segregation of short-beaked common dolphins Delphinus delphis in European Atlantic waters inferred from ecological tracers. Colloque ISOBAY (La Rochelle).

5-7 juin 2024 : Faure J., Niol J., Spitz J. (2024). Investigating dietary changes in the common dolphin (Delphinus delphis) in the Bay of Biscay over the last 20 years. Colloque ISOBAY (La Rochelle).

3-7 juin 2024 : Gourguet S., Bellanger M., Dudouet B., Thébaud O., Bécu N., LEHUTA S. (2024). Representing key interactions driving the dynamics of marine mammal -fisheries conflicts: a qualitative modelling approach. Marine Socio-Ecological Systems Symposium (Yokohama, Japon)

27-31 Mai 2024 : Malkócs T, Méndez-Fernandez P., Kiszka J., Murphy S., Covelo P., Torres-Pereira A., Alves F., Lapègue S., Viricel A. (2024). Genomic population structure of the common dolphin (Delphinus delphis) in the North-East Atlantic ocean. Colloque I-MarCo (Montpellier).

29 novembre – 1er décembre 2023 : Malkócs T., Arnaud-Haond S., Reisser C., Viricel-Pante A., Lapègue S. (2023). Comparing mitochondrial genetic diversity between biopsy and eDNA sampling in common dolphins. Journées du Réseau ADN-O (Cestas).

11-14 septembre 2023 : Ozanam B., Petitgas P. Huguet A. (2023 – poster). Satellite-derived marine environmental indices and their relations to higher trophic levels in the bay of Biscay. ICES Annual Science Conference (Bilbao, Espagne).

11-14 septembre 2023 : Brevet M., Dubroca L., Authier M. (2023 – poster). Building a comprehensive pipeline to estimate bycatch among fleets : a case study in the Bay of Biscay common dolphins (Delphinus delphis). ICES Annual Science Conference (Bilbao, Espagne).

11-14 septembre 2023 : Bellanger M., Dudouet B., Gourguet S., Thébaud O. (2023). Potentialities of incitative-based approaches to reduce marine mammal bycatch. ICES Annual Science Conference (Bilbao, Espagne).

6-8 juillet 2023 : Delalieux G., Barthold C. (2023). The “Science of Spin” in Science-Policy Interface: Corporate Playbook as a Way to control Public Policy Framing: The Case of Dolphins Bycatch in French Bay of Biscay. « Organizing for the Good Life: Between Legacy and Imagination » Colloquium (Cagliari, Italie).

12-13-14 décembre 2022 : Malkócs T., Viricel A., Arnaud S., Reisser C., Lapègue S. (2022). Using eDNA to investigate the presence and population-level genetic diversity of common dolphins in the Bay of Biscay. Colloque ADN-O « ADNe en milieu aquatique » (Rennes).

 

Packages analytiques R

Octobre 2023 : Authier M., Brevet M., Dubroca L. (2023). Cartographier le risque de captures de cétacés à partir des données d’effort de pêche et d’observation à la mer (Pelarpp). (L331)

Mars 2023 : Paillé J., Vignard C., Deslias C., Authier M., Peltier H. (2023). Identifier les stratégies de pêche individuelles des fileyeurs (package iTRAS). (L321)

Janvier 2023 : Rodriguez J. (2023). iapesca, a R-package for manipulating and interpretating high resolution geospatial data from fishing vessels. R tutorial. https://doi.org/10.13155/93094 (L321)

 

Cartographies

Janvier 2024 : Huguet A. (2023). Map of Chlorophyll a concentrations trend between 1998 and 2019 in the Gulf of Biscay. SEANOE. (L211). https://doi.org/10.17882/98111

Octobre 2023 : Doray M., Hebert-Burggraeve A., Olmos M., Authier M. (2023). Cartes de distribution saisonnières et interannuelles des principales proies des dauphins communs dans le GdG à partir des données existantes (L221). https://archimer.ifremer.fr/doc/00858/97040/

 

Rapports d’avancement projet

Octobre 2024 : Baranger L., Ollivier P. (2024). Caractérisation des flotilles à risques dans le golfe de Gascogne. (L432). 

Septembre 2024 : Bécu N., Regien M. (2024). Rapport sur le développement d’un simulateur interactif du socio-écosystème appliqué à la problématique des captures accidentelles. (L413)

Septembre 2024Lapègue S., Malkócs T., Cornette F., Méndez-Fernandez P., Spitz J., Bonin A., Reisser C., Arnaud S., Noël C., Viricel-Pante A. 2024. Jeux de séquences obtenues à partir d’ADNe. (L114)

Septembre 2024 : Doray M., Cambreling M., Ariza A., Le Bouffant N., Poncelet C., Veit E., Berger L., Ponchart M., Ducatel C., Duhamel E., Marchand L., Petitgas P. 2024. Caractérisation hydroacoustique de la distribution des dauphins communs et des petits poissons pélagiques dans le Golfe de Gascogne en février 2023 et 2024. (L222). https://doi.org/10.13155/101596

Juillet 2024 : Genu M., Authier M., Laran S., Spitz J. 2024. Distribution des petits delphininés en hiver : une distribution plus côtière ? (L131b).

Mai 2024 : Authier M., Genu M., Laran S., Spitz J. 2024. Variations d’habitats potentiels des dauphins (dauphin commun et dauphin bleu et blanc) : une analyse exploratoire (L212).

Mai 2024 : Brevet M., Demanèche S., Peltier H., Authier M. Dubroca L. 2024. Description des activités de pêches, cartographie et typologie des stratégies opérant dans le golfe de Gascogne (L311). https://doi.org/10.13155/99926

Février 2024 : Van Canneyt O., Blanchard A., Laran S., Dorémus G., Genu M., Sanchez T., Spitz J. 2024. Rapport de campagne CAPECET II (campagne d’observation aérienne de la mégafaune marine). Rapport de campagne. Observatoire Pelagis (UAR 3462, La Rochelle Université / CNRS). 41 p. (L131).

Décembre 2023 : Pillet M., Chouvelon T., Viricel-Pante A., Doray M., Authier M., Huguet A., Peltier H., Faillettaz R., Dubroca L., Gourguet S., Ridoux V., Lehuta S., Ulrich C., Petitgas P., Spitz J. (2023). DELMOGES : DELphinus MOuvements GEStion. Rapport intermédiaire 2023 (L51 – L53). https://archimer.ifremer.fr/doc/00868/98023/

Décembre 2023 : Bellanger M., Dudouet B., Gourguet S., Thebaud O., Ballance L., Becu N., Bisack K., Cudennec A., Daures F., Lehuta S., Lent R., Marshall C. T., Reid D., Ridoux V., Squires D., Ulrich C. (2023). Report of the Workshop Potentialities of incentive-based approaches to reduce dolphin bycatch in the Bay of Biscay organized in Brest on 16-17 March 2023 . https://archimer.ifremer.fr/recordview

Novembre 2023 : Sans M., Rodriguez J. (2023). Development and application of a machine-learning and geocomputation workflow for assessing the gear effort of gillnetters operating in the Bay of Biscay. 52p. https://doi.org/10.13155/97561

Octobre 2023 : Huguet A., Petitgas P., Dorand M., Ozanam B. (2023). Indices environnementaux et tableau de bord de leurs déviations rapport à la climatologie, 2000-2020. (L211).

Octobre 2023 : Cloâtre T., Dubroca L. (2023). Rapport sur le contenu de la base de données des captures accidentelles complétée et qualifiée. (L312).

Mars 2023 : Méndez-Fernandez P., Dabin W., Rouby E., Richard G., Lapègue S., Spitz J. (2023). Campagne de collecte de biopsies : DELphis golfe de Gascogne Océanique STructure. Rapport de campagne (L111). https://archimer.ifremer.fr/doc/00834/94566/

Décembre 2022 : Pillet M., Chouvelon T., Viricel-Pante A., Doray M., Authier M., Huguet A., Peltier H., Faillettaz R., Dubroca L., Gourguet S., Ridoux V., Lehuta S., Ulrich C., Petitgas P., Spitz J. (2022). DELMOGES : DELphinus MOuvements GEStion. Rapport intermédiaire 2022 (L51 – L53). https://archimer.ifremer.fr/doc/00814/92594/

 

Articles publiés

Juillet 2024 : Paillé J., Vignard C., Authier M., Bidenbach E., Deslias C., Tachoires S., Peltier H. (2024). Identification of static netters fishing trajectories with high resolution data and their evolution in the Bay of Biscay since 2015: Potential implications for short-beaked common dolphin bycatch. Fisheries Research 278, 107119. (L322)

Février 2024 : Ulrich C., Peltier H., Petitgas P., Spitz J. (2024). Que sait-on sur les captures accidentelles de dauphins dans le golfe de Gascogne, et pourquoi est-il si difficile de les éviter ? (L54). The Conversation

 

Rapports de stage

Ces rapports sont des exercices pédagogiques reflétant les travaux des étudiants durant leur stage. Les résultats présentés sont susceptibles d’évoluer.

Septembre 2023 : Hebert-Burggraeve A. Une approche d’intégration de données avec des modèles hiérarchiques pour caractériser les variations spatio-temporelles de la distribution des petits poissons pélagiques dans le Golfe de Gascogne / A data-integration approach with hierarchical models to reveal spatiotemporal variations of small pelagic fish distribution in the Bay of Biscay. Mémoire de fin d’études d’ingénieur en « Sciences Halieutiques et Aquacoles » (Ressources et Ecosystèmes Aquatiques) de l’Institut Agro Rennes-Angers (lnstitut national d’enseignement supérieur pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement.

Juillet 2023 : Sans M. Application de méthodes d’apprentissage statistique à la reconnaissance des opérations de pêche des fileyeurs. Thèse de Master 2, Université de Bretagne Occidentale.

Juin 2023 : Ozanam B. Indices environnementaux et corrélations avec les niveaux trophiques supérieurs dans le golfe de Gascogne. Thèse de Master 2, Université Sorbonne.

Juin 2023 : Jamet J. Comparaison de la contamination inorganique et de l’écologie alimentaire chez les dauphins communs morts de captures accidentelles vis-à-vis des autres causes de mortalité. Rapport de 2ème année de BUT Génie Ecologique.

Août 2022 : Paillé J. Identification des stratégies de pêche des fileyeurs par analyse des données AIS et de leur évolution suite à l’augmentation récente des captures accidentelles de dauphins communs dans le golfe de Gascogne. Thèse de Master 2, La Rochelle Université.

 

Réunions

27-28 mars2024 : Revoir les Journées Delmoges (bilan à 2 ans) du projet Delmoges

12-13 octobre 2023 : Revoir les Journées Delmoges (bilan à 18 mois) du projet Delmoges (journée scientifique parties 1 et 2 – journée « ateliers » parties 1 et 2)

29-30 mars 2023 : Revoir les Journées Delmoges (bilan 1ère année) du projet Delmoges

30-31 mars 2022 : Revoir la réunion de lancement du projet Delmoges

 

Livrables

L111 : Méndez-Fernandez P., Dabin W., Rouby E., Richard G., Lapègue S., Spitz J. (2023). Campagne de collecte de biopsies : DELphis golfe de Gascogne Océanique STructure. Rapport de campagne. https://archimer.ifremer.fr/doc/00834/94566/

L113Mille T., Caurant F., Méndez-Fernandez P., Pillet M., Spitz J., Viricel A., Alves F., Ferreira R., Covelo P., Pin X., López A., Torres-Pereira A., Eira C., Gaudino M., McHugh B., Murphy S., Marchand P., Venisseau A., Brault-Favrou M., Churlaud C., Guillou G., Dabin, W., Demaret F., Dumortier C., Mauchamp A., Le Guern R., Jamet J., Belliard M., Chouvelon T. 2024. Jeu de données « Traceurs écologiques ».

L114Lapègue S., Malkócs T., Cornette F., Méndez-Fernandez P., Spitz J., Bonin A., Reisser C., Arnaud S., Noël C., Viricel-Pante A. 2024. Jeux de séquences obtenues à partir d’ADNe.

L121Aminot Y., Briant N., Bely N., Bruzac S., Caurant F., Chouvelon T., Héas-Moisan K., Méndez-Fernandez P., Mille T., Olivier N., Pollono C., Spitz J., Sireau T., Munschy C. 2024. Jeu de données « Contaminants émergents ».

L131 : Van Canneyt O., Blanchard A., Laran S., Dorémus G., Genu M., Sanchez T., Spitz J. 2024. Rapport de campagne CAPECET II (campagne d’observation aérienne de la mégafaune marine). Rapport de campagne. Observatoire Pelagis (UAR 3462, La Rochelle Université / CNRS). 41 p.

L131b : Genu M., Authier M., Laran S., Spitz J. 2024. Distribution des petits delphininés en hiver : une distribution plus côtière ?

L211 : Huguet A., Petitgas P., Dorand M., Ozanam B. (2023). Indices environnementaux et tableau de bord de leurs déviations rapport à la climatologie, 2000-2020. & Huguet A. (2023). Map of Chlorophyll a concentrations trend between 1998 and 2019 in the Gulf of Biscay. SEANOE. https://doi.org/10.17882/98111

L212 : Authier M., Genu ., Laran S., Spitz J. 2024. Variations d’habitats potentiels des dauphins (dauphin commun et dauphin bleu et blanc) : une analyse exploratoire.

L221 : Doray M., Hebert-Burggraeve A., Olmos M., Authier M. (2023). Cartes de distribution saisonnières et interannuelles des principales proies des dauphins communs dans le GdG à partir des données existantes. https://archimer.ifremer.fr/doc/00858/97040/

L222 : Doray M., Cambreling M., Ariza A., Le Bouffant N., Poncelet C., Veit E., Berger L., Ponchart M., Ducatel C., Duhamel E., Marchand L., Petitgas P. 2024. Caractérisation hydroacoustique de la distribution des dauphins communs et des petits poissons pélagiques dans le Golfe de Gascogne en février 2023 et 2024. https://doi.org/10.13155/101596

L311 : Brevet M., Demanèche S., Peltier H., Authier M. Dubroca L. 2024. Description des activités de pêches, cartographie et typologie des stratégies opérant dans le golfe de Gascogne. https://doi.org/10.13155/99926

L312 : Cloâtre T., Dubroca L. (2023). Rapport sur le contenu de la base de données des captures accidentelles complétée et qualifiée.

L321 : Paillé J., Vignard C., Deslias C., Authier M., Peltier H. (2023). Identifier les stratégies de pêche individuelles des fileyeurs (package iTRAS). & Rodriguez J. (2023). iapesca, a R-package for manipulating and interpretating high resolution geospatial data from fishing vessels. R tutorial. https://doi.org/10.13155/93094

L322 : Paillé J., Vignard C., Authier M., Bidenbach E., Deslias C., Tachoires S., Peltier H. (2024). Identification of static netters fishing trajectories with high resolution data and their evolution in the Bay of Biscay since 2015: Potential implications for short-beaked common dolphin bycatch. Fisheries Research 278, 107119. https://doi.org/10.1016/j.fishres.2024.107119

L331 : Authier M., Brevet M., Dubroca L. (2023). Cartographier le risque de captures de cétacés à partir des données d’effort de pêche et d’observation à la mer (Pelarpp).

L413 : Bécu N., Regien M. (2024). Rapport sur le développement d’un simulateur interactif du socio-écosystème appliqué à la problématique des captures accidentelles.

L432 : Baranger L., Ollivier P. (2024). Caractérisation des flotilles à risques dans le golfe de Gascogne.

L51-53 (2023) : Pillet M., Chouvelon T., Viricel-Pante A., Doray M., Authier M., Huguet A., Peltier H., Faillettaz R., Dubroca L., Gourguet S., Ridoux V., Lehuta S., Ulrich C., Petitgas P., Spitz J. (2023). DELMOGES : DELphinus MOuvements GEStion. Rapport intermédiaire 2023. https://archimer.ifremer.fr/doc/00868/98023/

L51-53 (2022) : Pillet M., Chouvelon T., Viricel-Pante A., Doray M., Authier M., Huguet A., Peltier H., Faillettaz R., Dubroca L., Gourguet S., Ridoux V., Lehuta S., Ulrich C., Petitgas P., Spitz J. (2022). DELMOGES : DELphinus MOuvements GEStion. Rapport intermédiaire 2022. https://archimer.ifremer.fr/doc/00814/92594/

L54 : Ulrich C., Peltier H., Petitgas P., Spitz J. (2024). Que sait-on sur les captures accidentelles de dauphins dans le golfe de Gascogne, et pourquoi est-il si difficile de les éviter ? The Conversation